El pasado de Jason Bourne vuelve por él. En la segunda entrega de la saga de 3 películas basadas en la vida de Jason Bourne, un ex- agente de la CIA que pierde la memoria y mientras que lucha por recobrarla y conseguir saber quién es realmente, se ve implicado en una red de espionaje y manipulación de gobiernos por la parte de los USA donde va a ser perseguido por asesinos profesionales, mesnaderos paramilitares, y ex- compañeros de la CIA.La película empieza en Goa, India, donde Jason y Marie se han ido a vivir para ocultarse de Treadstone, mas allá un viejo agente de la compañía les encuentra y persigue. Jason Bourne empieza su aventura para descubrir su pasado recordando una parte de este, y persiguiendo al agente, que además de esto se hace pasar por él.